Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARCQ7LC44 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARCQ7LC44 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms