Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNDC1Q76NI1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNDC1Q76NI1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
KNDC1Q76NI1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KNDC1Q76NI1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KNDC1Q76NI1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms