Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
BRINP3Q76B58 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
BRINP3Q76B58 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms