Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
LINC00173Q6ZV60 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LINC00173Q6ZV60 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms