Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZN66

GBP6, Guanylate-binding protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP6Q6ZN66 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GBP6Q6ZN66 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GBP6Q6ZN66 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GBP6Q6ZN66 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms