Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C16orf54Q6UWD8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
C16orf54Q6UWD8 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms