Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC171Q6TFL3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC171Q6TFL3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms