Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC1Q6TDU7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC1Q6TDU7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms