Protein–RNA interactions for Protein: Q6SZW1

SARM1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARM1Q6SZW1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SARM1Q6SZW1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SARM1Q6SZW1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms