Protein–RNA interactions for Protein: Q6RI45

BRWD3, Bromodomain and WD repeat-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,802 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRWD3Q6RI45 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BRWD3Q6RI45 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRWD3Q6RI45 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms