Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
KLHL35Q6PF15 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
KLHL35Q6PF15 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms