Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EDC4Q6P2E9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
EDC4Q6P2E9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
EDC4Q6P2E9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms