Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE9

LCN8, Epididymal-specific lipocalin-8, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN8Q6JVE9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
LCN8Q6JVE9 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
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LCN8Q6JVE9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
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LCN8Q6JVE9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
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LCN8Q6JVE9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
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LCN8Q6JVE9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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LCN8Q6JVE9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
LCN8Q6JVE9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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