Protein–RNA interactions for Protein: Q68DU8

KCTD16, BTB/POZ domain-containing protein KCTD16, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD16Q68DU8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KCTD16Q68DU8 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCTD16Q68DU8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms