Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG16L1Q676U5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG16L1Q676U5 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms