Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RNF123Q5XPI4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF123Q5XPI4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms