Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPATA1Q5VX52 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPATA1Q5VX52 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms