Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GARNL3Q5VVW2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms