Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CCDC30Q5VVM6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC30Q5VVM6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms