Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV63

ATRNL1, Attractin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRNL1Q5VV63 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ATRNL1Q5VV63 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ATRNL1Q5VV63 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms