Protein–RNA interactions for Protein: Q5VV17

OTUD1, OTU domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD1Q5VV17 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
OTUD1Q5VV17 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
OTUD1Q5VV17 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD1Q5VV17 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD1Q5VV17 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD1Q5VV17 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD1Q5VV17 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD1Q5VV17 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD1Q5VV17 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
OTUD1Q5VV17 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms