Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SDHAF4Q5VUM1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SDHAF4Q5VUM1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SDHAF4Q5VUM1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms