Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GKAP1Q5VSY0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GKAP1Q5VSY0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms