Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF39

MFSD4B, Sodium-dependent glucose transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD4BQ5TF39 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
MFSD4BQ5TF39 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MFSD4BQ5TF39 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms