Protein–RNA interactions for Protein: Q5T011

SZT2, KICSTOR complex protein SZT2, humanhuman

Predictions only

Length 3,432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZT2Q5T011 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SZT2Q5T011 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SZT2Q5T011 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms