Protein–RNA interactions for Protein: Q5K4L6

SLC27A3, Long-chain fatty acid transport protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A3Q5K4L6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC27A3Q5K4L6 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC27A3Q5K4L6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms