Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS54

PSMG4, Proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4Q5JS54 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PSMG4Q5JS54 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms