Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SDK2Q58EX2 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
SDK2Q58EX2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms