Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB6CQ53S08 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB6CQ53S08 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms