Protein–RNA interactions for Protein: Q53GI3

ZNF394, Zinc finger protein 394, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF394Q53GI3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ZNF394Q53GI3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF394Q53GI3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF394Q53GI3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms