Protein–RNA interactions for Protein: Q53F19

NCBP3, Nuclear cap-binding protein subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP3Q53F19 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NCBP3Q53F19 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NCBP3Q53F19 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms