Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SBK1Q52WX2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SBK1Q52WX2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SBK1Q52WX2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms