Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC25A52Q3SY17 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC25A52Q3SY17 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms