Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPB7

AP5B1, AP-5 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP5B1Q2VPB7 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
AP5B1Q2VPB7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AP5B1Q2VPB7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms