Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC27Q2M243 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC27Q2M243 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms