Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KNOP1Q1ED39 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KNOP1Q1ED39 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms