Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CLPPQ16740 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CLPPQ16740 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
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