Protein–RNA interactions for Protein: Q16621

NFE2, Transcription factor NF-E2 45 kDa subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE2Q16621 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NFE2Q16621 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NFE2Q16621 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms