Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRNP35Q16560 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRNP35Q16560 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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