Protein–RNA interactions for Protein: Q16513

PKN2, Serine/threonine-protein kinase N2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN2Q16513 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PKN2Q16513 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PKN2Q16513 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms