Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC85BQ15834 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85BQ15834 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
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