Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
TWIST1Q15672 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TWIST1Q15672 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms