Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HMGN3Q15651 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HMGN3Q15651 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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