Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SF3B3Q15393 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SF3B3Q15393 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SF3B3Q15393 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
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