Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
UBE3CQ15386 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
UBE3CQ15386 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
UBE3CQ15386 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
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