Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KCNAB1Q14722 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KCNAB1Q14722 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms