Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

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Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
VGLL4Q14135 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
VGLL4Q14135 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
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