Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CACNA1CQ13936 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CACNA1CQ13936 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
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