Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
DDX39BQ13838 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DDX39BQ13838 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
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