Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FHL3Q13643 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
FHL3Q13643 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms